tokens
listlengths
2
145
ner_tags
listlengths
2
145
[ "Mutations", "in", "the", "desmin", "and", "the", "alpha-B", "crystallin", "genes", "account", "for", "approximately", "one", "third", "of", "the", "DRM", "cases", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "I-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O" ]
[ "The", "genetic", "basis", "of", "the", "other", "forms", "remain", "unknown", ",", "including", "the", "early-onset", ",", "recessive", "form", "with", "Mallory", "body-like", "inclusions", "(", "MB-DRMs", ")", ",", "first", "described", "in", "five", "related", "German", "patients", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-OrganismTaxon", "O" ]
[ "Recently", ",", "we", "identified", "the", "selenoprotein", "N", "gene", "(", "SEPN1", ")", "as", "responsible", "for", "SEPN-related", "myopathy", "(", "SEPN-RM", ")", ",", "a", "unique", "early-onset", "myopathy", "formerly", "divided", "in", "two", "different", "nosological", "categories", ":", "rigid", "spine", "muscular", "dystrophy", "and", "the", "severe", "form", "of", "classical", "multiminicore", "disease", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "I-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O" ]
[ "The", "finding", "of", "Mallory", "body-like", "inclusions", "in", "two", "cases", "of", "genetically", "documented", "SEPN-RM", "led", "us", "to", "suspect", "a", "relationship", "between", "MB-DRM", "and", "SEPN1", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O" ]
[ "In", "the", "original", "MB-DRM", "German", "family", ",", "we", "demonstrated", "a", "linkage", "of", "the", "disease", "to", "the", "SEPN1", "locus", "(", "1p36", ")", ",", "and", "subsequently", "a", "homozygous", "SEPN1", "deletion", "(", "del", "92", "nucleotide", "-19/+73", ")", "in", "the", "affected", "patients", "." ]
[ "O", "O", "O", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "B-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "O", "O", "O", "O", "B-OrganismTaxon", "O" ]
[ "A", "comparative", "reevaluation", "showed", "that", "MB-DRM", "and", "SEPN-RM", "share", "identical", "clinical", "features", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Therefore", ",", "we", "propose", "that", "MB-DRM", "should", "be", "categorized", "as", "SEPN-RM", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O" ]
[ "These", "findings", "substantiate", "the", "molecular", "heterogeneity", "of", "DRM", ",", "expand", "the", "morphological", "spectrum", "of", "SEPN-RM", ",", "and", "implicate", "a", "necessary", "reassessment", "of", "the", "nosological", "boundaries", "in", "early-onset", "myopathies", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O" ]
[ "Altered", "replication", "timing", "of", "the", "HIRA/Tuple1", "locus", "in", "the", "DiGeorge", "and", "Velocardiofacial", "syndromes", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "I-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O" ]
[ "DiGeorge", "and", "Velocardiofacial", "syndromes", "(", "DGS/VCFS", ")", "are", "endowed", "by", "a", "similar", "complex", "phenotype", "including", "cardiovascular", ",", "craniofacial", ",", "and", "thymic", "malformations", ",", "and", "are", "associated", "with", "heterozygous", "deletions", "of", "22q11", "chromosomal", "band", "." ]
[ "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "Typically", "Deleted", "Region", "in", "the", "22q11.21", "subband", "(", "here", "called", "TDR22", ")", "is", "very", "gene-dense", ",", "and", "the", "extent", "of", "the", "deletion", "has", "been", "defined", "precisely", "in", "several", "studies", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "to", "date", "there", "is", "no", "evidence", "for", "a", "mechanism", "of", "haploinsufficiency", "that", "can", "fully", "explain", "the", "DGS/VCFS", "phenotype", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O" ]
[ "In", "this", "study", ",", "we", "show", "that", "the", "candidate", "gene", "HIRA/Tuple1", "mapping", "on", "the", "non-deleted", "TDR22", ",", "in", "DGS/VCFS", "subjects", "presents", "a", "delayed", "replication", "timing", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "I-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Moreover", ",", "we", "observed", "an", "increase", "in", "the", "cell", "ratio", "showing", "the", "HIRA/Tuple1", "locus", "localised", "toward", "the", "nuclear", "periphery", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "I-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "is", "known", "that", "replication", "timing", "and", "nuclear", "location", "are", "generally", "correlated", "to", "the", "transcription", "activity", "of", "the", "relative", "DNA", "region", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "propose", "that", "the", "alteration", "in", "the", "replication/nuclear", "location", "pattern", "of", "the", "non-deleted", "TDR22", "indicates", "an", "altered", "gene", "regulation", "hence", "an", "altered", "transcritpion", "in", "DGS/VCFS", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O" ]
[ "Severe", "reversible", "left", "ventricular", "systolic", "and", "diastolic", "dysfunction", "due", "to", "accidental", "iatrogenic", "epinephrine", "overdose", "." ]
[ "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O" ]
[ "Catecholamine-induced", "cardiomyopathy", "due", "to", "chronic", "excess", "of", "endogenous", "catecholamines", "has", "been", "recognized", "for", "decades", "as", "a", "clinical", "phenomenon", "." ]
[ "B-ChemicalEntity", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "contrast", ",", "reports", "of", "myocardial", "dysfunction", "due", "to", "acute", "iatrogenic", "overdose", "are", "rare", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "35-year-old", "woman", "whose", "cervix", "uteri", "was", "inadvertently", "injected", "with", "8", "mg", "of", "epinephrine", "developed", "myocardial", "stunning", "that", "was", "characterized", "by", "severe", "hemodynamic", "compromise", ",", "profound", ",", "albeit", "transient", ",", "left", "ventricular", "systolic", "and", "diastolic", "dysfunction", ",", "and", "only", "modestly", "elevated", "biochemical", "markers", "of", "myocardial", "necrosis", "." ]
[ "O", "O", "B-OrganismTaxon", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O" ]
[ "Our", "case", "illustrates", "the", "serious", "consequences", "of", "medical", "errors", "that", "can", "be", "avoided", "through", "improved", "medication", "labeling", "and", "staff", "supervision", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Effects", "of", "the", "cyclooxygenase-2", "specific", "inhibitor", "valdecoxib", "versus", "nonsteroidal", "antiinflammatory", "agents", "and", "placebo", "on", "cardiovascular", "thrombotic", "events", "in", "patients", "with", "arthritis", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "B-ChemicalEntity", "I-ChemicalEntity", "I-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "B-OrganismTaxon", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O" ]
[ "There", "have", "been", "concerns", "that", "the", "risk", "of", "cardiovascular", "thrombotic", "events", "may", "be", "higher", "with", "cyclooxygenase", "(", "COX", ")", "-2-specific", "inhibitors", "than", "nonselective", "nonsteroidal", "antiinflammatory", "drugs", "(", "NSAIDs", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "I-GeneOrGeneProduct", "I-GeneOrGeneProduct", "I-GeneOrGeneProduct", "I-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "I-ChemicalEntity", "I-ChemicalEntity", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O" ]
[ "We", "evaluated", "cardiovascular", "event", "data", "for", "valdecoxib", ",", "a", "new", "COX-2-specific", "inhibitor", "in", "approximately", "8000", "patients", "with", "osteoarthritis", "and", "rheumatoid", "arthritis", "treated", "with", "this", "agent", "in", "randomized", "clinical", "trials", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "O", "O", "B-OrganismTaxon", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "incidence", "of", "cardiovascular", "thrombotic", "events", "(", "cardiac", ",", "cerebrovascular", "and", "peripheral", "vascular", ",", "or", "arterial", "thrombotic", ")", "was", "determined", "by", "analyzing", "pooled", "valdecoxib", "(", "10-80", "mg", "daily", ")", ",", "nonselective", "NSAID", "(", "diclofenac", "75", "mg", "bid", ",", "ibuprofen", "800", "mg", "tid", ",", "or", "naproxen", "500", "mg", "bid", ")", "and", "placebo", "data", "from", "10", "randomized", "osteoarthritis", "and", "rheumatoid", "arthritis", "trials", "that", "were", "6-52", "weeks", "in", "duration", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "incidence", "rates", "of", "events", "were", "determined", "in", "all", "patients", "(", "n", "=", "7934", ")", "and", "in", "users", "of", "low-dose", "(", "<", "or", "=325", "mg", "daily", ")", "aspirin", "(", "n", "=", "1051", ")", "and", "nonusers", "of", "aspirin", "(", "n", "=", "6883", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-OrganismTaxon", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Crude", "and", "exposure-adjusted", "incidences", "of", "thrombotic", "events", "were", "similar", "for", "valdecoxib", ",", "NSAIDs", ",", "and", "placebo", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "risk", "of", "serious", "thrombotic", "events", "was", "also", "similar", "for", "each", "valdecoxib", "dose", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O" ]
[ "Thrombotic", "risk", "was", "consistently", "higher", "for", "users", "of", "aspirin", "users", "than", "nonusers", "of", "aspirin", "(", "placebo", ",", "1.4", "%", "vs.", "0", "%", ";", "valdecoxib", ",", "1.7", "%", "vs.", "0.2", "%", ";", "NSAIDs", ",", "1.9", "%", "vs.", "0.5", "%", ")", "." ]
[ "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "rates", "of", "events", "in", "users", "of", "aspirin", "were", "similar", "for", "all", "3", "treatment", "groups", "and", "across", "valdecoxib", "doses", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O" ]
[ "Short-", "and", "intermediate-term", "treatment", "with", "therapeutic", "(", "10", "or", "20", "mg", "daily", ")", "and", "supratherapeutic", "(", "40", "or", "80", "mg", "daily", ")", "valdecoxib", "doses", "was", "not", "associated", "with", "an", "increased", "incidence", "of", "thrombotic", "events", "relative", "to", "nonselective", "NSAIDs", "or", "placebo", "in", "osteoarthritis", "and", "rheumatoid", "arthritis", "patients", "in", "controlled", "clinical", "trials", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "B-OrganismTaxon", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Identification", "of", "a", "novel", "WFS1", "mutation", "(", "AFF344-345ins", ")", "in", "Japanese", "patients", "with", "Wolfram", "syndrome", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "B-SequenceVariant", "O", "O", "O", "B-OrganismTaxon", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O" ]
[ "Wolfram", "syndrome", "(", "WFS", ")", "is", "an", "autosomal", "recessive", "disorder", "characterized", "by", "early", "onset", "diabetes", "mellitus", ",", "progressive", "optic", "atrophy", ",", "sensorineural", "deafness", "and", "diabetes", "insipidus", "." ]
[ "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O" ]
[ "Affected", "individuals", "may", "also", "have", "renal", "tract", "abnormalities", "as", "well", "as", "neurogical", "and", "psychiatric", "syndromes", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O" ]
[ "WFS1", "encoding", "a", "transmembrane", "protein", "was", "identified", "as", "the", "gene", "responsible", "for", "WFS", "." ]
[ "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O" ]
[ "We", "report", "herein", "a", "Japanese", "family", ",", "of", "which", "two", "members", "had", "this", "syndrome", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "the", "WFS1", "gene", "of", "these", "patients", ",", "we", "identified", "a", "novel", "mutation", ",", "a", "nine", "nucleotide", "insertion", "(", "AFF344-345ins", ")", "." ]
[ "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "O", "B-OrganismTaxon", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "O", "B-SequenceVariant", "O", "O" ]
[ "In", "addition", ",", "one", "of", "these", "patients", "had", "preclinical", "hypopituitarism", ",", "which", "is", "an", "unusual", "feature", "of", "WFS", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-OrganismTaxon", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O" ]
[ "As", "only", "the", "two", "family", "members", "homozygous", "for", "the", "mutation", "showed", "WFS", ",", "these", "data", "support", "the", "notion", "that", "this", "mutation", "is", "the", "cause", "of", "WFS", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O" ]
[ "A", "genetic", "analysis", "of", "serotonergic", "biosynthetic", "and", "metabolic", "enzymes", "in", "migraine", "using", "a", "DNA", "pooling", "approach", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Migraine", "is", "a", "common", "debilitating", "primary", "headache", "disorder", "with", "significant", "mental", ",", "physical", "and", "social", "health", "implications", "." ]
[ "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "brain", "neurotransmitter", "5-hydroxytryptamine", "(", "5-HT", ";", "serotonin", ")", "is", "involved", "in", "nociceptive", "pathways", "and", "has", "been", "implicated", "in", "the", "pathophysiology", "of", "migraine", "." ]
[ "O", "O", "B-ChemicalEntity", "B-ChemicalEntity", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O" ]
[ "With", "few", "genetic", "studies", "investigating", "biosynthetic", "and", "metabolic", "enzymes", "governing", "the", "rate", "of", "5-HT", "activity", "and", "their", "relationship", "to", "migraine", ",", "it", "was", "the", "objective", "of", "this", "study", "to", "assess", "genetic", "variants", "within", "the", "human", "tryptophan", "hydroxylase", "(", "TPH", ")", ",", "amino", "acid", "decarboxylase", "(", "AADC", ")", "and", "monoamine", "oxidase", "A", "(", "MAOA", ")", "genes", "in", "migraine", "susceptibility", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-OrganismTaxon", "B-GeneOrGeneProduct", "I-GeneOrGeneProduct", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "I-GeneOrGeneProduct", "I-GeneOrGeneProduct", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "I-GeneOrGeneProduct", "I-GeneOrGeneProduct", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O" ]
[ "This", "objective", "was", "undertaken", "using", "a", "high-throughput", "DNA", "pooling", "experimental", "design", ",", "which", "proved", "to", "be", "a", "very", "accurate", ",", "sensitive", "and", "specific", "method", "of", "estimating", "allele", "frequencies", "for", "single", "nucleotide", "polymorphism", ",", "insertion", "deletion", "and", "variable", "number", "tandem", "repeat", "loci", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Application", "of", "DNA", "pooling", "to", "a", "wide", "array", "of", "genetic", "loci", "provides", "greater", "scope", "in", "the", "assessment", "of", "population-based", "genetic", "association", "study", "designs", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Despite", "the", "application", "of", "this", "high-throughput", "genotyping", "method", ",", "negative", "results", "from", "the", "two-stage", "DNA", "pooling", "design", "used", "to", "screen", "loci", "within", "the", "TPH", ",", "AADC", "and", "MAOA", "genes", "did", "not", "support", "their", "role", "in", "migraine", "susceptibility", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O" ]
[ "5-Fluorouracil", "cardiotoxicity", "induced", "by", "alpha-fluoro-beta-alanine", "." ]
[ "B-ChemicalEntity", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O" ]
[ "Cardiotoxicity", "is", "a", "rare", "complication", "occurring", "during", "5-fluorouracil", "(", "5-FU", ")", "treatment", "for", "malignancies", "." ]
[ "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O" ]
[ "We", "herein", "report", "the", "case", "of", "a", "70-year-old", "man", "with", "5-FU-induced", "cardiotoxicity", ",", "in", "whom", "a", "high", "serum", "level", "of", "alpha-fluoro-beta-alanine", "(", "FBAL", ")", "was", "observed", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-OrganismTaxon", "O", "B-ChemicalEntity", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "patient", ",", "who", "had", "unresectable", "colon", "cancer", "metastases", "to", "the", "liver", "and", "lung", ",", "was", "referred", "to", "us", "for", "chemotherapy", "from", "an", "affiliated", "hospital", ";", "he", "had", "no", "cardiac", "history", "." ]
[ "O", "B-OrganismTaxon", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "After", "admission", ",", "the", "patient", "received", "a", "continuous", "intravenous", "infusion", "of", "5-FU", "(", "1000", "mg/day", ")", ",", "during", "which", "precordial", "pain", "with", "right", "bundle", "branch", "block", "occurred", "concomitantly", "with", "a", "high", "serum", "FBAL", "concentration", "of", "1955", "ng/ml", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-OrganismTaxon", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Both", "the", "precordial", "pain", "and", "the", "electrocardiographic", "changes", "disappeared", "spontaneously", "after", "the", "discontinuation", "of", "5-FU", "." ]
[ "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O" ]
[ "As", "the", "precordial", "pain", "in", "this", "patient", "was", "considered", "to", "have", "been", "due", "to", "5-FU-induced", "cardiotoxicity", ",", "the", "administration", "of", "5-FU", "was", "abandoned", "." ]
[ "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "B-OrganismTaxon", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O" ]
[ "Instead", ",", "oral", "administration", "of", "S-1", "(", "a", "derivative", "of", "5-FU", ")", ",", "at", "200", "mg/day", "twice", "a", "week", ",", "was", "instituted", ",", "because", "S-1", "has", "a", "strong", "inhibitory", "effect", "on", "dihydropyrimidine", "dehydrogenase", ",", "which", "catalyzes", "the", "degradative", "of", "5-FU", "into", "FBAL", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "B-ChemicalEntity", "O" ]
[ "The", "serum", "FBAL", "concentration", "subsequently", "decreased", "to", "352", "ng/ml", ",", "the", "same", "as", "the", "value", "measured", "on", "the", "first", "day", "of", "S-1", "administration", "." ]
[ "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O" ]
[ "Thereafter", ",", "no", "cardiac", "symptoms", "were", "observed", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O" ]
[ "The", "patient", "achieved", "a", "partial", "response", "6", "months", "after", "the", "initiation", "of", "the", "S-1", "treatment", "." ]
[ "O", "B-OrganismTaxon", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O" ]
[ "The", "experience", "of", "this", "case", ",", "together", "with", "a", "review", "of", "the", "literature", ",", "suggests", "that", "FBAL", "is", "related", "to", "5-FU-induced", "cardiotoxicity", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O" ]
[ "S-1", "may", "be", "administered", "safely", "to", "patients", "with", "5-FU-induced", "cardiotoxicity", "." ]
[ "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O", "B-OrganismTaxon", "O", "B-ChemicalEntity", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O" ]
[ "Pilocarpine", "seizures", "cause", "age-dependent", "impairment", "in", "auditory", "location", "discrimination", "." ]
[ "B-ChemicalEntity", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O" ]
[ "Children", "who", "have", "status", "epilepticus", "have", "continuous", "or", "rapidly", "repeating", "seizures", "that", "may", "be", "life-threatening", "and", "may", "cause", "life-long", "changes", "in", "brain", "and", "behavior", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "extent", "to", "which", "status", "epilepticus", "causes", "deficits", "in", "auditory", "discrimination", "is", "unknown", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O" ]
[ "A", "naturalistic", "auditory", "location", "discrimination", "method", "was", "used", "to", "evaluate", "this", "question", "using", "an", "animal", "model", "of", "status", "epilepticus", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O" ]
[ "Male", "Sprague-Dawley", "rats", "were", "injected", "with", "saline", "on", "postnatal", "day", "(", "P", ")", "20", ",", "or", "a", "convulsant", "dose", "of", "pilocarpine", "on", "P20", "or", "P45", "." ]
[ "O", "O", "B-OrganismTaxon", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Pilocarpine", "on", "either", "day", "induced", "status", "epilepticus", ";", "status", "epilepticus", "at", "P45", "resulted", "in", "CA3", "cell", "loss", "and", "spontaneous", "seizures", ",", "whereas", "P20", "rats", "had", "no", "cell", "loss", "or", "spontaneous", "seizures", "." ]
[ "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "B-OrganismTaxon", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O" ]
[ "Mature", "rats", "were", "trained", "with", "sound-source", "location", "and", "sound-silence", "discriminations", "." ]
[ "O", "B-OrganismTaxon", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Control", "(", "saline", "P20", ")", "rats", "acquired", "both", "discriminations", "immediately", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-OrganismTaxon", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "status", "epilepticus", "(", "P20", ")", "rats", ",", "acquisition", "of", "the", "sound-source", "location", "discrimination", "was", "moderately", "impaired", "." ]
[ "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "B-OrganismTaxon", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Status", "epilepticus", "(", "P45", ")", "rats", "failed", "to", "acquire", "either", "sound-source", "location", "or", "sound-silence", "discriminations", "." ]
[ "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "B-OrganismTaxon", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Status", "epilepticus", "in", "rat", "causes", "an", "age-dependent", ",", "long-term", "impairment", "in", "auditory", "discrimination", "." ]
[ "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "B-OrganismTaxon", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O" ]
[ "This", "impairment", "may", "explain", "one", "cause", "of", "impaired", "auditory", "location", "discrimination", "in", "humans", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "B-OrganismTaxon", "O" ]
[ "No", "independent", "role", "of", "the", "-1123", "G", ">", "C", "and+2740", "A", ">", "G", "variants", "in", "the", "association", "of", "PTPN22", "with", "type", "1", "diabetes", "and", "juvenile", "idiopathic", "arthritis", "in", "two", "Caucasian", "populations", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "INTRODUCTION", ":", "The", "PTPN22", "is", "a", "negative", "regulator", "of", "the", "T", "cell", "response", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Its", "+1858C", ">", "T", "(", "R620W", ")", "polymorphism", "has", "been", "shown", "to", "associate", "with", "a", "risk", "for", "multiple", "autoimmune", "diseases", ",", "including", "type", "1", "diabetes", "(", "T1D", ")", "and", "juvenile", "idiopathic", "arthritis", "(", "JIA", ")", "." ]
[ "O", "B-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "O", "B-SequenceVariant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O" ]
[ "The", "minor", "(", "susceptibility", ")", "allele", "is", "absent", "in", "Asian", "populations", ",", "but", "a", "recent", "study", "suggested", "an", "independent", "involvement", "of", "another", "polymorphism", "located", "within", "the", "promoter", "-1123", "nucleotides", "relative", "to", "the", "translational", "start", "site", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "AIMS", ":", "We", "aimed", "to", "analyse", "the", "association", "of", "three", "PTPN22", "polymorphisms", "in", "two", "distinct", "Caucasian", "populations", ",", "the", "Czechs", "(", "with", "T1D", "and", "with", "JIA", ")", "and", "Azeri", "(", "with", "T1D", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O" ]
[ "METHODS", ":", "The", "single", "nucleotide", "polymorphisms", "(", "SNP", ")", "at", "positions", "-1123", "(", "rs2488457", ")", ",", "+1858", "(", "rs2476601", ",", "the", "R620W", "substitution", ")", ",", "and", "+2740", "(", "rs1217412", ")", "were", "genotyped", "using", "TaqMan", "assays", "in", "372", "subjects", "with", "childhood-onset", "T1D", ",", "130", "subjects", "with", "JIA", ",", "and", "400", "control", "subjects", "of", "Czech", "origin", ",", "and", "in", "160", "subjects", "with", "T1D", "and", "271", "healthy", "controls", "of", "Azeri", "origin", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SequenceVariant", "O", "O", "O", "O", "B-SequenceVariant", "O", "O", "B-SequenceVariant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SequenceVariant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "RESULTS", ":", "In", "the", "Czechs", ",", "all", "three", "SNPs", "were", "in", "a", "tight", "linkage", "disequlibrium", ",", "while", "in", "the", "Azeri", ",", "the", "linkage", "disequlibrium", "was", "limited", "to", "between", "the", "promoter", "and", "3'-UTR", "polymorphism", ",", "D", "'", "(", "-1123", ",", "+2740", ")", "=0.99", ",", "r", "(", "2", ")", "=0.72", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Haplotype", "reconstruction", "via", "the", "expectation-maximization", "algorithm", "showed", "in", "both", "populations", "that", "only", "the", "haplotype", "containing", "the", "minor", "(", "W", ")", "allele", "at", "codon", "620", "was", "associated", "with", "T1D", "(", "OR=2.26", ",", "95", "%", "CI", "1.68-3.02", "in", "Czechs", ",", "OR=14.8", ",", "95", "%", "CI", "2.0-651", "in", "Azeri", ")", "or", "JIA", "(", "OR=2.43", ",", "95", "%", "CI", "1.66-3.56", "in", "Czechs", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "haplotypes", "having", "the", "wild-type", "(", "R", ")", "allele", "at", "codon", "620", "and", "minor", "alleles", "at", "-1123", "and/or", "+2740", "were", "neutral", "as", "to", "the", "risk", "of", "autoimmune", "conditions", "in", "both", "populations", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O" ]
[ "CONCLUSIONS", ":", "In", "two", "different", "Caucasian", "populations", ",", "the", "Czechs", "and", "the", "Azeri", ",", "no", "independent", "contribution", "can", "be", "detected", "either", "of", "the", "-1123", "promoter", "SNP", "or", "the", "+2740", "3'-UTR", "SNP", ",", "and", "only", "the", "minor", "allele", "at", "PTPN22", "codon", "620", "contributes", "to", "the", "risk", "of", "autoimmunity", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "polymorphism", "of", "C-to-T", "substitution", "at", "-31", "IL1B", "is", "associated", "with", "the", "risk", "of", "advanced", "gastric", "adenocarcinoma", "in", "a", "Japanese", "population", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Proinflammatory", "cytokine", "gene", "polymorphisms", "have", "been", "demonstrated", "to", "associate", "with", "gastric", "cancer", "risk", ",", "of", "which", "IL1B-31T/C", "and", "-511C/T", "changes", "have", "been", "well", "investigated", "due", "to", "the", "possibility", "that", "they", "may", "alter", "the", "IL1B", "transcription", "." ]
[ "B-GeneOrGeneProduct", "I-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "I-SequenceVariant", "O", "B-SequenceVariant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O" ]
[ "The", "signal", "transduction", "target", "upon", "interleukin", "1", "beta", "(", "IL1beta", ")", "stimulation", ",", "the", "nuclear", "factor", "of", "kappa", "B", "(", "NFkappaB", ")", "activation", ",", "supports", "cancer", "development", ",", "signal", "transduction", "in", "which", "is", "mediated", "by", "FS-7", "cell-associated", "cell", "surface", "antigen", "(", "FAS", ")", "signaling", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "I-GeneOrGeneProduct", "I-GeneOrGeneProduct", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "I-GeneOrGeneProduct", "I-GeneOrGeneProduct", "I-GeneOrGeneProduct", "I-GeneOrGeneProduct", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "I-GeneOrGeneProduct", "I-GeneOrGeneProduct", "I-GeneOrGeneProduct", "I-GeneOrGeneProduct", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "O" ]
[ "Based", "on", "recent", "papers", "describing", "the", "prognostic", "roles", "of", "the", "polymorphisms", "and", "the", "NFkappaB", "functions", "on", "cancer", "development", ",", "we", "sought", "to", "determine", "if", "Japanese", "gastric", "cancer", "patients", "were", "affected", "by", "the", "IL1B", "-31/-511", "and", "FAS-670", "polymorphisms", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "B-OrganismTaxon", "O", "O", "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O" ]
[ "A", "case-control", "study", "was", "conducted", "on", "incident", "gastric", "adenocarcinoma", "patients", "(", "n=271", ")", "and", "age-gender", "frequency-matched", "control", "subjects", "(", "n=271", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "B-OrganismTaxon", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "observed", "strong", "linkage", "disequilibrium", "between", "the", "T", "allele", "at", "-511", "and", "the", "C", "allele", "at", "-31", "and", "between", "the", "C", "allele", "at", "-511", "and", "the", "T", "allele", "at", "-31", "in", "IL1B", "in", "both", "the", "cases", "and", "controls", "(", "R", "(", "2", ")", "=0.94", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "O", "O", "B-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "O", "O", "O", "B-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "O", "O", "B-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "I-SequenceVariant", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Neither", "IL1B-31", ",", "-511", "nor", "FAS-670", "polymorphisms", "showed", "significantly", "different", "risks", "of", "gastric", "adenocarcinoma", "." ]
[ "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O" ]
[ "Though", "FAS-670", "polymorphisms", "did", "not", "show", "any", "significant", "difference", ",", "the", "proportion", "of", "subjects", "with", "IL1B-31TT", "(", "or", "IL1B-511CC", ")", "increased", "according", "to", "stage", "(", "trend", "P=0.019", ")", "." ]
[ "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "I-SequenceVariant", "O", "O", "I-SequenceVariant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "particular", ",", "subjects", "with", "stage", "IV", "had", "a", "two", "times", "higher", "probability", "of", "having", "either", "IL1B-31TT", "(", "or", "IL1B-511CC", ")", "genotype", "compared", "with", "stage", "I", "subjects", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "I-SequenceVariant", "O", "O", "I-SequenceVariant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "observations", "suggest", "that", "IL1B-31TT", "and", "IL1B-511CC", "are", "associated", "with", "disease", "progression", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "I-SequenceVariant", "O", "I-SequenceVariant", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Chloroacetaldehyde", "as", "a", "sulfhydryl", "reagent", ":", "the", "role", "of", "critical", "thiol", "groups", "in", "ifosfamide", "nephropathy", "." ]
[ "B-ChemicalEntity", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "I-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O" ]
[ "Chloroacetaldehyde", "(", "CAA", ")", "is", "a", "metabolite", "of", "the", "alkylating", "agent", "ifosfamide", "(", "IFO", ")", "and", "putatively", "responsible", "for", "renal", "damage", "following", "anti-tumor", "therapy", "with", "IFO", "." ]
[ "B-ChemicalEntity", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "I-ChemicalEntity", "B-ChemicalEntity", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "I-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O" ]
[ "Depletion", "of", "sulfhydryl", "(", "SH", ")", "groups", "has", "been", "reported", "from", "cell", "culture", ",", "animal", "and", "clinical", "studies", "." ]
[ "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "work", "the", "effect", "of", "CAA", "on", "human", "proximal", "tubule", "cells", "in", "primary", "culture", "(", "hRPTEC", ")", "was", "investigated", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "B-OrganismTaxon", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Toxicity", "of", "CAA", "was", "determined", "by", "protein", "content", ",", "cell", "number", ",", "LDH", "release", ",", "trypan", "blue", "exclusion", "assay", "and", "caspase-3", "activity", "." ]
[ "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "I-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O" ]
[ "Free", "thiols", "were", "measured", "by", "the", "method", "of", "Ellman", "." ]
[ "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "CAA", "reduced", "hRPTEC", "cell", "number", "and", "protein", ",", "induced", "a", "loss", "in", "free", "intracellular", "thiols", "and", "an", "increase", "in", "necrosis", "markers", "." ]
[ "B-ChemicalEntity", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "B-DiseaseOrPhenotypicFeature", "O", "O" ]
[ "CAA", "but", "not", "acrolein", "inhibited", "the", "cysteine", "proteases", "caspase-3", ",", "caspase-8", "and", "cathepsin", "B.", "Caspase", "activation", "by", "cisplatin", "was", "inhibited", "by", "CAA", "." ]
[ "B-ChemicalEntity", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "I-GeneOrGeneProduct", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "B-GeneOrGeneProduct", "I-GeneOrGeneProduct", "B-GeneOrGeneProduct", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O" ]
[ "In", "cells", "stained", "with", "fluorescent", "dyes", "targeting", "lysosomes", ",", "CAA", "induced", "an", "increase", "in", "lysosomal", "size", "and", "lysosomal", "leakage", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ChemicalEntity", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]